飞秒激光手术是目前最先进的一种角膜激光手术，具有较低的副作用，它通过对角膜厚度进行激光切割，使角膜达到原始的屈光效果，矫正近视眼，同时还能矫正其它的屈光不正，由于是有创手术，因此也会产生一些副作用，例如：角膜持续水肿，无法消退，可能与免疫反应有关；角膜瓣移位，可能与排除水分不良有关；甚至可能再次近视，这可能与术前患有高度近视，不稳定有关。

当出现并发症时应尽早做检查，术后要严格按照医嘱用药，定期复查。手术对近视眼无危害，但相对也有一定的弊端。目前在临床上，近视是无法治疗的，手术也是通过减少角膜的厚度来改变眼睛的屈光度，并不能完全治疗近视。手术后如继续用眼疲劳，仍可再次近视。其他患者术后出现散光和眩光。发生眼压增高，易引起锥形角膜形成。手术技术相对成熟，目前对近视眼没有什么危害。