治疗强直性脊柱炎可以使用非甾体消炎药、缓解病情的抗风湿药以及生物制剂等，在使用中要注意这些药物的不良反应，比如非甾体消炎药在止疼同时可能会对患者的消化道、心血管产生危害，部分患者因为长期大量甚至不合理的联合使用非甾体抗炎药，会导致消化性溃疡、消化道出血的发生。
缓解病情的抗风湿药有助于控制强直性脊柱炎患者外周病变的进展，但这些药对肝脏的功能有影响，服用时建议密切监测患者的肝功能，生物制剂是治疗强直性脊柱炎非常重要的一个药物，使用时要按严格筛查，明确患者是否存在乙肝或结核这种情况，及时给予相应干预，避免因为使用生物制剂导致结核活动及肝炎病毒复制。
