通常梅毒患者首选苄星青霉素进行治疗，不用口服药物。只有对青霉素过敏，同时又对头孢曲松钠过敏的患者才考虑口服药物，通常选择口服多西环素或者阿奇霉素等药物进行治疗，但是疗程相对较长，可能需要连续15天口服药物才能达到治疗的目的。相对而言，上述药物的口服效果没有长效的苄星青霉素效果好。
梅毒患者治疗时最主要的是按时复诊，要求复诊三年，初期可能要求患者三个月来一次医院，在第二年时半年来一次，最后一年来一次即可。部分梅毒患者可能经过一次的治疗后，皮疹会消退，患者就不重视疾病，但是早期梅毒是有传染性的，所以一定要定期复诊。梅毒患者如果对青霉素不过敏，则治疗疗程是非常短的，每周注射一次苄星青霉素，早期梅毒患者注射3～4次就足够了。对于晚期梅毒患者而言，可能需要3～4次的治疗。但是对于心血管梅毒、神经梅毒的患者而言，通常需要住院治疗，其治疗周期相对较长。
